# Réviser l'histologie dentaire

Ce module permet à l'étudiante ou à l'étudiant de réviser ses connaissances en terme d'histologie dentaire, sur la base d'un large corpus d'images simulant des coupes de dents montées en lames minces.

Ce corpus est constitué de vues globales au niveau de la dent complète, puis de vues détaillant certaines structures d'intérêt (ROI primaires), enfin de grossissements de ces structures elle-mêmes, documentant certaines sous-structures (ROI secondaires). Chaque niveau de grossissement est largement légendé.

Comme les autres, ce module est activable au niveau de la barre de modules en haut à gauche de l'écran.

{% hint style="info" %}
Choix du module 2 : :mouse\_three\_button:<mark style="color:blue;">barre de modules grise en haut à gauche</mark>
{% endhint %}

À l'activation du module 2 :&#x20;

* le microscope 3D devient inactif ;
* une bande verticale contenant des vignettes des lames minces dentaires apparaît vers le milieu de l'écran.

Cette bande est une métaphore de porte-lames : l'ensemble des spécimens dentaires de la collection peuvent être consultés depuis cette interface

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## Sélection d'un spécimen

Le passage de la souris sur l'une des vignettes permet d'identifier le spécimen en coupe, du point de vue anatomo-taxinomique. Un *scroll* de la molette de la souris permet de faire défiler les vignettes de la bande porte-lames et d'accéder ainsi à la totalité de la collection.

La sélection d'une lame mince se fait par simple clic. Cette activation entraîne l'apparition, sur la partie gauche de l'écran :&#x20;

* d'une vue grand format de la coupe dentaire. Cette vue est munie :&#x20;
  * de zones figurant les ROI primaires ;&#x20;
  * d'un bouton permettant d'afficher des informations supplémentaires (c'est-à-dire des légendes hors *ROI*) disponibles pour le spécimen en question.
* d'un descriptif du spécimen sélectionné, dans la barre d'information beige en bas à gauche de l'écran. Ces informations sont :&#x20;
  * les identifiants du spécimen (dans la collection virtuelle et dans la collection réelle de l'UMR PACEA) ;
  * le rappel de l'identification anatomo-taxinomique ;
  * la nature actuelle ou fossile de la pièce (avec mention du contexte dans ce dernier cas)
  * le plan de coupe ;
  * l'auteur des clichés et des illustrations associés au spécimen ;
* d'une barre d'information supplémentaire (blanche, tout en bas à gauche) contenant l'auteur de la lame mince, ainsi que le DOI de ces mêmes clichés dans le cas où ils ont été déposés en parallèle sur la plateforme [Nakala](https://nakala.fr/).

<figure><img src="https://2927642565-files.gitbook.io/~/files/v0/b/gitbook-x-prod.appspot.com/o/spaces%2FUXDShGzZ2YnHDJbvf5Oe%2Fuploads%2F2HicEePIjeOemWwjytp4%2Fporte_lames%5B00h00m00s-00h00m20s%5D.gif?alt=media&#x26;token=86ea6121-d77b-4909-b183-2c5d4113a46a" alt=""><figcaption><p>Sélection des spécimens de lames minces</p></figcaption></figure>

Il est à tout moment possible de remplacer à la volée le spécimen sélectionné par un autre. On peut également désélectionner le spécimen courant en cliquant sur la case de fermeture en haut à droite de l'écran.

<img src="https://2927642565-files.gitbook.io/~/files/v0/b/gitbook-x-prod.appspot.com/o/spaces%2FUXDShGzZ2YnHDJbvf5Oe%2Fuploads%2FxcBG7N3GCgYC6IDj0uKp%2Ffile.excalidraw.svg?alt=media&#x26;token=eddde90f-3d8d-4f14-a4de-5b4931a6512a" alt="Organisation des spécimens de lames minces" class="gitbook-drawing">

{% hint style="info" %}
Sélection d'un spécimen de lame mince&#x20;

* identification du spécimen : 🖱️ *<mark style="color:blue;">rollover</mark>* <mark style="color:blue;"></mark><mark style="color:blue;">sur la bande porte-lames</mark>
* défilement de la bande porte-lames : 🖱️ *<mark style="color:blue;">scroll</mark>* <mark style="color:blue;"></mark><mark style="color:blue;">sur la bande</mark>
* sélection d'un spécimen : 🖱️ <mark style="color:blue;">clic gauche</mark>
* affichage des information supplémentaires (hors ROI) : 🖱️ <mark style="color:blue;">clic gauche sur le bouton "infos" en haut à gauche du grand cliché</mark>
* désélection du spécimen en cours : 🖱️ :x: <mark style="color:blue;">clic sur la case de fermeture en haut à droite</mark>
  {% endhint %}

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## Sélection des ROI

### ROI primaire

Les ROI primaires du spécimen sélectionné sont figurées sur la photographie de la lame mince par des rectangles blancs. On peut les identifier par *rollover* sur l'emprise de chacun d'entre elles. Le rectangle de la ROI survolée devient <mark style="color:orange;">orange</mark>.

Un clic sur une ROI primaire entraîne l'apparition du grossissement correspondant, en haut à droite de l'écran. L'identification de la ROI apparait également dans la barre de titre au-dessus du cliché : identifiant, nature, grossissement utilisé.

Cette barre de titre est également munie d'un bouton d'information, à gauche, permettant d'activer les légendes de la ROI primaire sélectionnée.

Le rectangle de la ROI sélectionnée devient alors <mark style="color:green;">vert</mark>. Il est à tout moment possible de resélectionner une autre ROI primaire, par simple clic sur son rectangle.

<figure><img src="https://2927642565-files.gitbook.io/~/files/v0/b/gitbook-x-prod.appspot.com/o/spaces%2FUXDShGzZ2YnHDJbvf5Oe%2Fuploads%2F5NlEoAzrVptYPArD0UfP%2Fselection_roi_i%5B00h00m00s-00h00m20s%5D.gif?alt=media&#x26;token=208c0dd1-b216-4753-9e66-080380956f3f" alt=""><figcaption><p>Sélection des ROI primaires</p></figcaption></figure>

{% hint style="info" %}
ROI primaire

* sélection d'une ROI primaire : 🖱️ <mark style="color:blue;">clic sur l'emprise de la ROI — au niveau du cliché du spécimen</mark>
* affichage des information supplémentaires de la ROI primaire : 🖱️ <mark style="color:blue;">clic gauche sur le bouton "infos" à gauche de la barre de titre de la ROI primaire</mark>
  {% endhint %}

### ROI secondaire

Les ROI secondaires de la ROI primaire en cours de consultation sont également figurées par des rectangles blancs, sur le cliché en haut à droite.

Comme pour les ROI du niveau précédent, on peut les identifier par *rollover* sur l'emprise de chacun d'entre eux. Le rectangle de la ROI survolée devient <mark style="color:orange;">orange</mark>.

De la même manière, un clic sur une ROI secondaire entraîne l'apparition du grossissement correspondant, ainsi que la barre d'identification, cette fois en bas à droite de l'écran. Ici aussi le rectangle de la ROI secondaire sélectionnée devient <mark style="color:green;">vert</mark>.

Comme pour les ROI primaires, la barre de titre est munie d'un bouton d'information, permettant d'afficher les légendes.

Le fonctionnement des deux niveaux de ROI est identique.

{% hint style="info" %}
ROI secondaire

* sélection d'une ROI secondaire : 🖱️ <mark style="color:blue;">clic sur l'emprise de la ROI — au niveau du cliché de la ROI primaire</mark>
* affichage des information supplémentaires de la ROI secondaire : 🖱️ <mark style="color:blue;">clic gauche sur le bouton "infos" à gauche de la barre de titre de la ROI secondaire</mark>
  {% endhint %}

<figure><img src="https://2927642565-files.gitbook.io/~/files/v0/b/gitbook-x-prod.appspot.com/o/spaces%2FUXDShGzZ2YnHDJbvf5Oe%2Fuploads%2F2F0bcQ3r0gsgjRmemze6%2Fselection_roi_ii%5B00h00m00s-00h00m05s%5D.gif?alt=media&#x26;token=b1567a7c-3528-46e9-886e-d4dcfa0aa4c1" alt=""><figcaption><p>Sélection des ROI secondaires</p></figcaption></figure>

<img src="https://2927642565-files.gitbook.io/~/files/v0/b/gitbook-x-prod.appspot.com/o/spaces%2FUXDShGzZ2YnHDJbvf5Oe%2Fuploads%2FzPBU5JI15daMTzdL5d5G%2Ffile.excalidraw.svg?alt=media&#x26;token=0e8d25c7-b02e-4728-8a20-b13e8eb32e37" alt="Emboitement des clichés de lames minces" class="gitbook-drawing">

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## Liste des spécimens

Les lames minces de la collection virtuelle ont été fabriquées à partir de dents humaines ou animales (Ongulés essentiellement, mais aussi Rongeurs et Carnivores), actuelles ou fossiles. La liste des 50 spécimens la composant est présentée ci-dessous.

<table><thead><tr><th width="72">ID</th><th width="122">EFFECTIF ROI</th><th width="190">IDENTIFICATION</th><th>COUPE</th></tr></thead><tbody><tr><td>S1</td><td>7</td><td>P4 de Bœuf</td><td>Longitudinale (mésio-distale)</td></tr><tr><td>S2</td><td>3</td><td>P3 sup. humaine</td><td>Vestibulo-linguale</td></tr><tr><td>S3</td><td>3</td><td>M3 sup. Phacochère</td><td>Vestibulo-linguale</td></tr><tr><td>S4</td><td>3</td><td>Canine humaine</td><td>Transverse de la racine</td></tr><tr><td>S5</td><td>3</td><td>M2 inf. de Renne</td><td>Longitudinale (mésio-distale) des racines</td></tr><tr><td>S6</td><td>4</td><td>I1 de Bœuf</td><td>Longitudinale (vestibulo-linguale)</td></tr><tr><td>S7</td><td>2</td><td>Côte humaine</td><td>Tranverse</td></tr><tr><td>S8</td><td>3</td><td>P1 humaine</td><td>Tranverse</td></tr><tr><td>S9</td><td>3</td><td>Molaire de Renne</td><td>Longitudinale (portion radiculaire)</td></tr><tr><td>S10</td><td>5</td><td>M1 sup. humaine</td><td>Vestibulo-linguale</td></tr><tr><td>S11</td><td>3</td><td>I3 de Mouton</td><td>Transverse</td></tr><tr><td>S12</td><td>5</td><td>Canine d'Hyène</td><td>Transverse</td></tr><tr><td>S13</td><td>3</td><td>I3 de Mouton</td><td>Transverse proche apex racine</td></tr><tr><td>S14</td><td>4</td><td>M2 sup. humaine</td><td>Longituninale vestibulo-lingual</td></tr><tr><td>S15</td><td>2</td><td>I2 de Mouton</td><td>Transverse</td></tr><tr><td>S16</td><td>2</td><td>M1 inf. de Renne</td><td>Longitudinale sur racine mésiale</td></tr><tr><td>S17</td><td>6</td><td>M2 sup. humaine</td><td>Vestibulo-linguale</td></tr><tr><td>S18</td><td>6</td><td>M3 sup. humaine</td><td>Vestibulo-linguale</td></tr><tr><td>S19</td><td>3</td><td>P3 sup. Rhinocérotidé</td><td>Vestibulo-linguale</td></tr><tr><td>S20</td><td>14</td><td>M3 d'Élan</td><td>Vestibulo-linguale</td></tr><tr><td>S21</td><td>14</td><td>P3 de Renard</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S22</td><td>11</td><td>Canine de Chat</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S23</td><td>13</td><td>Molaires de Chevreuil </td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S24</td><td>15</td><td>P4 de Chevreuil </td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S25</td><td>24</td><td>P4 de Ragondin</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S26</td><td>12</td><td>P2 de Chevreuil</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S27</td><td>18</td><td>Molaires de Sanglier</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S28</td><td>14</td><td>Canine de Blaireau</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S29</td><td>11</td><td>D4 de Mouton</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S30</td><td>8</td><td>Canine de Renard </td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S31</td><td>14</td><td>Molaires de Ragondin </td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S32</td><td>10</td><td>I1 de Ragondin</td><td>Longitudinale (portion basale)</td></tr><tr><td>S33</td><td>8</td><td>I1 de Ragondin</td><td>Longitudinale (portion apicale)</td></tr><tr><td>S34</td><td>7</td><td>I2 de Bœuf</td><td>Transverse dans la couronne</td></tr><tr><td>S35</td><td>6</td><td>I2 de Bœuf</td><td>Transverse dans le collet</td></tr><tr><td>S36</td><td>8</td><td>I2 de Bœuf</td><td>Transverse à l’apex de la racine</td></tr><tr><td>S37</td><td>7</td><td>I2 de Cheval </td><td>Transverse dans la couronne</td></tr><tr><td>S38</td><td>8</td><td>I2 de Cheval</td><td>Transverse dans le collet</td></tr><tr><td>S39</td><td>10</td><td>I2 de Cheval </td><td>Transverse dans la racine</td></tr><tr><td>S40</td><td>8</td><td>I2 de Cheval</td><td>Transverse à l’apex de la racine</td></tr><tr><td>S41</td><td>8</td><td>Incisive de Marmotte</td><td>Longitudinale (portion apicale)</td></tr><tr><td>S42</td><td>10</td><td>Incisive de Marmotte</td><td>Longitudinale (portion basale)</td></tr><tr><td>S43</td><td>13</td><td>Incisive de Ragondin</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S44</td><td>18</td><td>M2 de Bœuf</td><td>Transverse dans la couronne</td></tr><tr><td>S45</td><td>13</td><td>Molaires de Marmotte</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S46</td><td>13</td><td>M2 de Cochon</td><td>Longitudinale</td></tr><tr><td>S47</td><td>14</td><td>M2 de Mouton</td><td>Transverse dans la couronne</td></tr><tr><td>S48</td><td>12</td><td>M2 de Mouton</td><td>Transverse au collet</td></tr><tr><td>S49</td><td>13</td><td>M2 de Mouton</td><td>Transverse à l’apex de la racine</td></tr><tr><td>S50</td><td>5</td><td>M2 de Blaireau</td><td>Longitudinale</td></tr></tbody></table>
