Description générale du TP

Objectifs

Le TP virtuel de microscopie (nom d'usage "STEP Microscopie") permet aux étudiantes et étudiants du Master de s’exercer au fonctionnement d’un microscope et — comme champ d'application pratique — à la reconnaissance microscopique d’échantillons histologiques dentaires.

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Matériel

Le matériel pédagogique virtuel est constitué :

• d'un microscope 3D en partie manipulable, analogue à un instrument réel de marque Leica disponible à l'UMR 5199 PACEA dans le cadre des TP réels ;

• de la documentation connexe (textuelle, photographique, vidéo) permettant de se refamiliariser avec les éléments du microscope et leur utilisation (terminologie, fonctionnement, calibration) ;

• d'un jeu de micro-photographies légendées de coupes histologiques effectuées dans des restes dentaires actuels essentiellement, et quelques restes fossiles.

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Environnement

L'application est structurée autour de trois modules. Deux d'entre eux reposent sur la manipulation directe de certains éléments du microscope viruel 3D :

• le module 1 : comprendre le fonctionnement du microscope ;

• le module 3 : régler le microscope.

Dans les deux modules, la place du microscope est centrale, tant au niveau des concepts qu'au niveau de l'interface : les manipulations à effectuer s'y font directement, dans un environnement 3D.

Comprendre le fonctionnement du microscopeRégler le microscope

Le module 2 est en revanche centrée sur l'apprentissage ou la révision de structures histologiques dentaires. L'interface repose dans ce cadre sur la manipulation d'images 2D, laissant le microscope et l'environnement 3D en image de fond.

Les photographies de coupes histologiques sont organisées selon trois corpus en poupées gigognes :

• les spécimens de coupes dentaires ;

• les régions d'intérêt primaires ou ROI (regions of Interest) primaires, structures d'intérêt au sein desdits spécimens ;

• enfin les régions d'intérêt secondaires ou ROI secondaires, structures d'intérêt au sein des ROI primaires.

L'ensemble de ces jeux photographiques sont légendés de manière très complète.

Réviser l'histologie dentaire